Bardzo dobrym nośnikiem ciepła są wody gruntowe. Warunkiem zastosowana takiego systemu jest odpowiednia wydajność warstwy wodonośnej w m3/h. Bardzo ważnym aspektem są również parametry fizykochemiczne, jakim musi odpowiadać woda, minimalna temperatura zastosowania około +7°C, prawidłowy układ to system dwóch studni – eksploatacyjnej i zrzutowej. W praktyce systemy woda-woda projektuje się i wykonuje w zakresie mocy od kilku do kilkuset kW, ponieważ uniwersalność urządzenia pozwala na rozbudowę systemów.